Для того, чтобы сдружить Flex Builder 3 и Windows Vista, пришлось скопировать установленный Flex Builder с компьютера с Windows XP, запустить файлики Player\win\Install Flash Player 9 ActiveX.exe и Player\win\install flash player 9 plugin.exe - только таким образом все заработало. Сам по себе Eclipse с вистой работает корректно, так что... Для беты есть workaround, будем надеяться, что к релизу будут дружить "из коробки".
Ах да, у меня на работе новый компьютер - сижу и радуюсь, как все летает. Довольно дешево, но сердито - двухъядерный Athlon. FlexBuilder стал летать побыстрее, а IDEA летает на скорости, опережающей скорость мысли.